El CO₂ es esencial para la asimilación de nutrientes por parte de las plantas. Este se encuentra en el acuario ya que las bacterias en el proceso de transformación de  los desechos de los peces (y demás organismos vivos que tengamos en el acuario), restos de comida y hojas muertas,  liberan CO₂  También es liberado en el proceso de respiración de peces, bacterias, caracoles etc., y las plantas en la noche consumen oxigeno O₂  y liberan CO₂

En acuarios con plantas es importante conservar el CO₂, por lo tanto debemos minimizar el movimiento en la superficie del agua para evitar que éste escape  por el intercambio gaseoso que origina este movimiento. Si observamos que las plantas están creciendo bien y  bonitas no necesitamos  adicionar CO₂. Si  detuvieron el crecimiento puede deberse a la falta de CO₂ disuelto en el agua y se puede adicionar de varias formas; en el comercio encontramos diversas métodos para  introducir CO₂ en el acuario.  También podemos hacerlo en forma casera con Azúcar blanca, levadura (en gránulos),  bicarbonato y una botella oscura.

El oxigeno en un acuario es fundamental, sin él no puede vivir sus habitantes. El oxigeno se ve afectado por otros parámetros, como por ejemplo, la temperatura; a mayor temperatura menos oxigeno disuelto en el agua.

La mejor manera de suministrar oxigeno a un acuario es cultivando plantas o utilizando aireadores, filtro o cualquier otro accesorio que haga mover la superficie del agua. Si se tiene una cantidad moderada de peces y  tenemos plantas no necesitamos  utilizar aireadores, ya que las plantas  en el proceso de la fotosíntesis la oxigena. 

Los mismos peces con su comportamiento nos indican si el agua del acuario tiene el oxigeno suficiente. Cuando éste falta los peces en grupo se van a la superficie del agua y si no se les proporciona oxigeno rápido ellos mueren. La falta de oxigeno la puede ocasionar la adición de drogas al acuario. Si tenemos que tratar a los peces por alguna enfermedad que se ha presentado, es importante aumentar la aireación.